Giai đoạn 2 của dự án được thực hiện từ năm 2007 đến nay. Trong quá trình trình tu, các chuyên gia đã nghiên cứu thành công chất kết dính, phục vụ công tác tu bổ phục hồi các đền tháp.
Hội An hiện có 1.360 di tích - danh thắng với 1.273 di tích kiến trúc - nghệ thuật, chiếm hơn 93%, trong đó có 28 di tích đã được Bộ VHTT&DL cấp bằng công nhận di tích cấp quốc gia